در خلاصه داستان فیلم محمد رسول‌الله آمده است:
ابرهه یکی از فرماندهان سپاه حبشه که به فرمان پادشاه حبشه لشکرکشی می‌کند تا خانه خدا را از بین ببرد.
ابرهه با چندین هزار نفر با اسب و فیل و تجهیزات به سمت مکه می‌آیند، اما به اراده خداوند در ۳ کیلومتری مکه که حریم مکه محسوب می‌شود، فیل‌ها قدم از قدم برنمی‌دارند و میلیون‌ها پرنده ابابیل (پرستوهای کوچک) در حالی که سنگ‌هایی در منقار خود دارند، که این سنگ‌ها، سنگ‌هایی از جهنم است بر سر لشکریان ابرهه فرو می‌ریزد و همه را از بین می‌برد.
یک ماه بعد از حمله ابرهه، پیامبر اسلام حضرت محمد (ص) به دنیا می‌آید و فیلم دوران جاهلیت و ظلم و ستمی که به مردم می‌رود را به تصویر درمی‌آورد و پیامبر که شاهد وقایع تلخ دوران جاهلیت است را تا سن ۱۳ سالگی پیامبر تصدیق می‌کند.
